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簡(jiǎn)單講述熒光定量 PCR 原理
更新時(shí)間:2020-02-13瀏覽:3005次

標簽:熒光定量 PCR PCR 試劑  實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 耗材 

所謂實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 技術(shù) ,是指在 PCR 反應體系中加入熒光基團,利用熒光信號積累實(shí)時(shí)監測整個(gè) PCR 進(jìn)程,后通過(guò)標準曲線(xiàn)對未知模板進(jìn)行定量分析的方法。以下便是天津本生生物就熒光定量 PCR 原理的簡(jiǎn)要說(shuō)明,一起來(lái)看下:

檢測方法:

1.SYBRGreenⅠ法:在 PCR 反應體系中,加入過(guò)量 SYBR 熒光染料,SYBR 熒光染料特異性地摻入 DNA 雙鏈后,發(fā)射熒光信號,而不摻入鏈中的 SYBR 染料分子不會(huì )發(fā)射任何熒光信號,從而保證熒光信號的增加與 PCR 產(chǎn)物的增加*同步。SYBR 定量 PCR 擴增熒光曲線(xiàn)圖 PCR 產(chǎn)物熔解曲線(xiàn)圖 (單一峰圖表明 PCR 擴增產(chǎn)物的單一性)

2.TaqMan 探針?lè )ǎ禾结樛暾麜r(shí),報告基團發(fā)射的熒光信號被淬滅基團吸收;PCR 擴增時(shí),Taq 酶的 5』-3』外切酶活性將探針酶切降解,使報告熒光基團和淬滅熒光基團分離,從而熒光監測系統可接收到熒光信號,即每擴增一條 DNA 鏈,就有一個(gè)熒光分子形成,實(shí)現了熒光信號的累積與 PCR 產(chǎn)物的形成*同步。

1. 熒光閾值 (threshold) 的設定 PCR 反應的前 15 個(gè)循環(huán)的熒光信號作為熒光本底信號,熒光閾值的缺省 (默認) 設置是 3-15 個(gè)循環(huán)的熒光信號的標準偏差的 10 倍,即:threshold = 10*SDcycle 3-152. Ct 值與起始模板的關(guān)系每個(gè)模板的 Ct 值與該模板的起始拷貝數的對數存在線(xiàn)性關(guān)系,公式如下。Ct =-1/lg(1+Ex)*lgX0+lgN/lg(1+Ex)n 為擴增反應的循環(huán)次數,X0 為初始模板量,Ex 為擴增效率,N 為熒光擴增信號達到閾值強度時(shí)擴增產(chǎn)物的量。起始拷貝數越多,Ct 值越小。利用已知起始拷貝數的標準品可作出標準曲線(xiàn),其中橫坐標代表起始拷貝數的對數,縱坐標代 Ct 值。因此,只要獲得未知樣品的 Ct 值,即可從標準曲線(xiàn)上計算出該樣品的起始拷貝數。

實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 所使用的熒光物質(zhì)可分為兩種:

1. TaqMan 熒光探針:PCR 擴增時(shí)在加入一對引物的同時(shí)加入一個(gè)特異性的熒光探針,該探針為一寡核苷酸,兩端分別標記一個(gè)報告熒光基團和一個(gè)淬滅熒光基團。探針完整時(shí),報告基團發(fā)射的熒光信號被淬滅基團吸收;PCR 擴增時(shí),Taq 酶的 5'-3' 外切酶活性將探針酶切降解,使報告熒光基團和淬滅熒光基團分離,從而熒光監測系統可接收到熒光信號,即每擴增一條 DNA 鏈,就有一個(gè)熒光分子形成,實(shí)現了熒光信號的累積與 PCR 產(chǎn)物形成*同步。而新型 TaqMan-MGB 探針使該技術(shù)既可進(jìn)行基因定量分析,又可分析基因突變 (SNP),有望成為基因診斷和個(gè)體化用藥分析的當選技術(shù)平臺。

2. SYBR 熒光染料:在 PCR 反應體系中,加入過(guò)量 SYBR 熒光染料,SYBR 熒光染料非特異性地摻入 DNA 雙鏈后,發(fā)射熒光信號,而不摻入鏈中的 SYBR 染料分子不會(huì )發(fā)射任何熒光信號,從而保證熒光信號的增加與 PCR 產(chǎn)物的增加*同步。SYBR 僅與雙鏈 DNA 進(jìn)行結合,因此可以通過(guò)溶解曲線(xiàn),確定 PCR 反應是否特異。

3. 分子信標:是一種在 5 和 3 末端自身形成一個(gè) 8 個(gè)堿基左右的發(fā)夾結構的莖環(huán)雙標記寡核苷酸探針,兩端的核酸序列互補配對,導致熒光基團與淬滅基團緊緊靠近,不會(huì )產(chǎn)生熒光。PCR 產(chǎn)物生成后,退火過(guò)程中,分子信標中間部分與特定 DNA 序列配對,熒光基因與淬滅基因分離產(chǎn)生熒光 。

1. 傳統定量 PCR 方法簡(jiǎn)介:

1) 內參照法:在不同的 PCR 反應管中加入已定量的內標和引物,內標用基因工程方法合成。上游引物用熒光標記,下游引物不標記。在模板擴增的同時(shí),內標也被擴增。在 PCR 產(chǎn)物中,由于內標與靶模板的長(cháng)度不同,二者的擴增產(chǎn)物可用電泳或高效液相分離開(kāi)來(lái),分別測定其熒光強度,以?xún)葮藶閷φ斩看龣z測模板。

2) 競爭法:選擇由突變克隆產(chǎn)生的含有一個(gè)新內切位點(diǎn)的外源競爭性模板。在同一反應管中,待測樣品與競爭模板用同一對引物同時(shí)擴增 (其中一個(gè)引物為熒光標記)。擴增后用內切酶消化 PCR 產(chǎn)物,競爭性模板的產(chǎn)物被酶解為兩個(gè)片段,而待測模板不被酶切,可通過(guò)電泳或高效液相將兩種產(chǎn)物分開(kāi),分別測定熒光強度,根據已知模板推測未知模板的起始拷貝數。3)PCR-ELISA 法:利用 digaoxin 或生物素等標記引物,擴增產(chǎn)物被固相板上特異的探針所結合,再加入抗 digaoxin 或生物素酶標抗體-辣根過(guò)氧化物酶結合物,終酶使底物顯色。常規的 PCR-ELISA 法只是定性實(shí)驗,若加入內標,作出標準曲線(xiàn),也可實(shí)現定量檢測目的。

2. 內標在傳統定量中的作用由于傳統定量方法都是終點(diǎn)檢測,即 PCR 到達平臺期后進(jìn)行檢測,而 PCR 經(jīng)過(guò)對數期擴增到達平臺期時(shí),檢測重現性極差。同一個(gè)模板在 96 孔 PCR 儀上做 96 次重復實(shí)驗,所得結果有很大差異,因此無(wú)法直接從終點(diǎn)產(chǎn)物量推算出起始模板量。加入內標后,可部分消除終產(chǎn)物定量所造成的不準確性。但即使如此,傳統的定量方法也都只能算作半定量、粗略定量的方法。

3. 內標對定量 PCR 的影響若在待測樣品中加入已知起始拷貝數的內標,則 PCR 反應變?yōu)殡p重 PCR,雙重 PCR 反應中存在兩種模板之間的干擾和競爭,尤其當兩種模板的起始拷貝數相差比較大時(shí),這種競爭會(huì )表現得更為顯著(zhù)。但由于待測樣品的起始拷貝數是未知的,所以無(wú)法加入合適數量的已知模板作為內標。也正是這個(gè)原因,傳統定量方法雖然加入內標,但仍然只是一種半定量的方法。 實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 技術(shù)有效地解決了傳統定量只能終點(diǎn)檢測的局限,實(shí)現了每一輪循環(huán)均檢測一次熒光信號的強度,并記錄在電腦軟件之中,通過(guò)對每個(gè)樣品 Ct 值的計算,根據標準曲線(xiàn)獲得定量結果。

因此,實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 無(wú)需內標是建立在兩個(gè)基礎之上的:

1)Ct 值的重現性 PCR 循環(huán)在到達 Ct 值所在的循環(huán)數時(shí),剛剛進(jìn)入真正的指數擴增期 (對數期),此時(shí)微小誤差尚未放大,因此 Ct 值的重現性*,即同一模板不同時(shí)間擴增或同一時(shí)間不同管內擴增,得到的 Ct 值是恒定的。

2)Ct 值與起始模板的線(xiàn)性關(guān)系由于 Ct 值與起始模板的對數存在線(xiàn)性關(guān)系,可利用標準曲線(xiàn)對未知樣品進(jìn)行定量測定,因此,實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 是一種采用外標準曲線(xiàn)定量的方法。外標準曲線(xiàn)的定量方法相比內標法是一種準確的、值得信賴(lài)的科學(xué)方法。利用外標準曲線(xiàn)的實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 是迄今為止定量準確,重現性的定量方法,已得到*的*,廣泛用于基因表達研究、轉基因研究,藥物療效考核、病原體檢測等諸多領(lǐng)域。 各級各類(lèi)醫療機構、大學(xué)及研究所、CDC、檢驗檢疫局、獸醫站、食品企業(yè)及乳品廠(chǎng)等。由于 qPCR 是實(shí)時(shí)定量檢測致病病原體基因核酸,因此它比化學(xué)發(fā)光、時(shí)間分辨、蛋白芯片等免疫學(xué)方法更具獨到優(yōu) 

產(chǎn)品優(yōu)勢:
本生生物代理實(shí)驗室耗材,PCR 耗材品種全,可替代儀器原廠(chǎng)耗材,性?xún)r(jià)比高,質(zhì)量穩定,對用戶(hù)可以節省實(shí)驗成本。

適應客戶(hù):
醫院檢驗科 PCR 實(shí)驗室,中心實(shí)驗室,肝病中心;第三方檢測機構,科研院所,大專(zhuān)院校,制藥廠(chǎng),試劑生產(chǎn)廠(chǎng)家,疾控中心,檢驗檢疫。

注:本信息終歸屬權:本生 (天津) 健康科技有限公司,以上信息僅供參考!

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